Restablecer sistema es una opción para recuperar de daños de Software en el sistema interno de la PS3, tales como datos corruptos, no inicia bien el sistema, o el GameOS esta dejando de funcionar de como debe.
Formatear el disco duro desde una PS3, prácticamente, NO borra el sistema, ya que para formatear el disco duro, te pide que insertes un USB con el Firmware Actual o superior obviamente no hay riesgo (exceptuando de que se te corte la luz, y ahí si que hay problemas graves), solo hace que la PS3 parte desde 0. Es algo inútil ya que uno puede respaldar la información en un disco duro Externo y después recuperarla, solo sirve para cuando la vallas a vender, o para instalar un nuevo disco duro o para desinstalar un CFW.

Lo del Ruido te recomiendo que lo lleves a un técnico de Sony o al SAT de Sony, a lo mejor es el lector o el ventilador y eso puede llegar a ser grave. Usar el "establecer sistema" no te arreglará el problema porque esa opción es solo para archivos del sistema, no problemas de HardWare.

Saludos