Según las fotos, estas poniendo bien el Clip (Cabeza) al lado correcto de la NOR, y eso descalifica uno de los posibles causante. Pero a la vez, me fijo que doblas muy cerrado el cable, y que pones la cinta adhesiva muy cerca de los extremos de las dobladas.

Aquí te hago un conteo de lo que tengo en mente de cual es el problema:
•Suciedad en las superficies y en el clip. (probable)
•Clip Roto
•Cable del Clip Roto (muy probable)
•NOR Samsung (causa problemas con el E3)

Para descartar casa uno, has lo siguiente:
1) Saca con cuidado el Clip y la cinta Adhesiva, recuerda que la superficie es como de papel, así que la cinta se pega fácilmente y al retirarlo, puedes rasgar la superficie.
2) Deja el clip en la mesa, no lo estires ni lo aplanes, deja que quede en la forma que quede.
3) con una lupa potente, revisa los micro cables del cable del clip, lo podrás diferenciar fácilmente de las rallas del cable porque estos van en otra forma. Empieza del final (donde va en el chip del E3) hasta el clip (donde va en el NOR) para ver los micro cables. Revisa de que no haya ninguno deformado, roto o desviado. Si hay uno, entonces rompiste el Cable. Pero si no ves nada roto, no descartes que ese sea el problema, una revisión visual no es muy exacta.
4) A la NOR de la PS3 y mira que dice, si sale algo de "Samsung", entonces ese es el problema. Para solucionarlo, tienes que instalar una actualización especial para las NOR Samsung en el E3 Flasher. Si no es de Samsung, entonces ese no es el problema y queda en descarte.
5) Limpia de nuevo todo con Limpia contactos, y antes de poner el Clip, revisa con una lupa potente si quedo pelos o algo parecido. Tienes que ser rápido si donde vives hay polvo, para que no caigan pelos mientras cambias.
6) Cuando pongas el clip, tienes que presionar en todos los lados pero bien suave, si solo oyes 1 "Clip" (el sonido), entonces esta roto el Clip. Para solucionarlo es fácil, tienes que poner tanta espuma sea necesaria como para que el techo de la placa de metal apriete (yo use 2 capas de la espuma De la caja, pero mi modelo es una Slim, y puede que la placa de metal de las Fat deje mas espacio que las de la Slim).

Con eso puedes descargas cada punto.

Ahora, un problema aparte, me fije que tu no estas poniendo de la crema Disoersadora de calor en las placas de los procesadores (son dos metales al lado de la NOR, son los chips mas grande de la placa madre, se diferencian de los demás por ser de metal). Eso es una falta grave, ya que esa pasta hace que no se caliente los procesadores, y si tu no lo cambias cada vez que lo desarmes, vas a hacer que los procesadores o la placa madre generen mas calor y se fundan, y eso ya es un problema difícil de solucionar. Para reemplazarla, tu lo quitas con alcohol en una servilleta, después lo secas y le pones la pasta, y con un pedazo plástico plano y grande cuadrado o triangular, lo esparces por todo el procesador. No importa que queden excesos en las esquinas (al menos de que sean grandes), pero si una parte queda sin pasta, eso no se debe permitir, y le pones un poco de pasta ahí. Todo esto para mantener a salvo la PS3 por dentro ;).

Saludos y suerte

No es por desanimarte pero hay e3 flasher que no funcionan y si lo haces funcionar ten mucho cuidado con todos los pasos que realices ya que hay mucho peligro de brick.

Un saludo.

Yo también tuve ese error, la solución es mas que limpiar, yo tuve que hacer esto:
1) Sacar el Clip de ambos extremos (desde la Placa madre y del E3 Flasher [La tarjeta que va en el HDD])
2) Con un limpia contacto, limpia con un pincel suave y que no deje rastro la NOR (el chip donde va el clip) por unos 30 segundos. Limpia todo, desde la parte de arriba, a los contactos y alrededor del chip.
3) Rápidamente con una lupa, inspecciona que no haya ningún pelo, polvo o suciedad. Tienes que set meticulosamente.
4) Repite el mismo proceso con el Clip desde la cara donde va el Chip.
5) Inserta el Clip, después usa alguna espuma y pegalo con cinta adesiva de doble cara al NOR. Yo use la espuma que separa entre el Clip y el Chip en la caja de Nor Flasher del E3 Flasher.
6) Limpia el chip del E3 Flasher que va en el hueco del HDD, ya que se llen fácilmente de polvo.
7)Repetir los pasos 2 y 3 con el conector del Clip y el puerto de Chip (por eso te dije que lo desconectaras)
8 Probar de nuevo, si no funciona, repetir todo hasta que funciona... Recuerda ser meticuloso y tener cuidado al desarmar/armar tu PS3

Saludos y suerte